Misją tego ośrodka jest rozwój i doskonalenie nowoczesnych metod analiz i badania jakości oraz bezpieczeństwa surowca, produktów ubocznych, badań w toku produkcji oraz wyrobów gotowych (mleko i produkty mleczarskie), poprzez opracowywanie innowacyjnych matrycowych materiałów odniesienia, zawierających bioaktywne składniki coraz powszechniejsze we współczesnych produktach mleczarskich. Szczegółowe zadania tej jednostki to realizacja projektów badawczych dotyczących opracowania i wytwarzania matrycowych materiałów odniesienia mleka i jego przetworów oraz produkcja materiałów odniesienia (RM) i materiałów kontroli jakości (QCM), w tym wzorców kalibracyjnych.
Jednostka ta przeprowadza również porównania między laboratoryjne i badania biegłości w zakresie analiz mleka i produktów mleczarskich. Ważnym aspektem pracy ośrodka jest wsparcie aplikacyjne i merytoryczne laboratoriów przemysłowych branży, w zakresie kalibracji i kontroli urządzeń analitycznych służących do badań mleka i produktów mleczarskich w oparciu o techniki absorpcji promieniowania w zakresie bliskiej podczerwieni (NIR) oraz średniej podczerwieni (MIR). Na wyposażeniu ośrodka znajdują się spektrometry NIR i MIR.